Le Conseil général de l’alimentation, de l’agriculture et des espaces ruraux (CGAAER) est présidé par le ministre en charge de l’agriculture. Le CGAAER assure des missions de conseil, d’expertise, d’évaluation, d’audit et d’inspection, par exemple sur des questions stratégiques comme l’agro-écologie et la lutte contre le changement climatique, la gestion de crises de marché ou de crises sanitaires, l’appui à l’international. Il peut aussi participer à la conception de lois.
Le CGAAER et le CGEDD ont été chargés d'examiner les problèmes sanitaires et de bien-être animal rencontrés depuis 2012 par des élevages riverains d’un parc éolien en Loire-Atlantique.
Une mission interministérielle a été chargée d'opérer un retour d'expérience sur les deux épisodes caniculaires de l'été 2019 et leur impact sur les forêts, les milieux naturels et les infrastructures.
Le CGAAER a été chargé de conduire une mission d’expertise et de conseil sur l’organisation du service d’autopsie des animaux dans l’Yonne à partir du 1er septembre 2020, date de la vente du site de Champignelles par l’École nationale vétérinaire d’Alfort.
La Nièvre est une zone intermédiaire qui peut construire de la valeur en élevage sur ses territoires avec des outils d'abattage de taille modeste, modernisés, la transformation des viandes, et la contractualisation ; mais elle doit aussi consolider sa vocation de département naisseur.
La loi du 16 janvier 2015 a instauré au 1er janvier 2016 treize grandes régions issues du regroupement des vingt-deux régions métropolitaines. S’adaptant à la nouvelle carte administrative, le MAA a créé sept nouvelles DRAAF, par fusion de seize DRAAF préexistantes, dans le respect de trois principes : le maintien des compétences et des parcours professionnels ; la concertation avec les agents et leurs représentants ; le choix du multisites, qui permet de ne pas procéder à des mobilités géographiques obligatoires. La mission visait à dresser le bilan organisationnel et social de cette réorganisation.
Une mission interministérielle a été chargée d’auditer la politique des risques en région Grand Est en particulier les sujets jugés les plus critiques.
Le CGAAER et le CGEDD ont été chargés d'examiner les problèmes sanitaires et de bien-être animal rencontrés depuis 2012 par des élevages riverains d'un parc éolien en Loire-Atlantique.
Pour fournir des résultats à la hauteur des objectifs à atteindre, la politique de maîtrise de la pollution des eaux par les nitrates d’origine agricole doit gagner en efficacité. Des solutions issues du numérique et des raisonnements agronomiques sont mobilisables pour mieux responsabiliser les acteurs agricoles.