Le budget du ministère, présenté selon les dispositions de la LOLF, manifeste le maintien de l'effort national pour soutenir les évolutions structurelles de l'agriculture, de la forêt et de la pêche.
La contribution du ministère de l'agriculture et de la pêche à l'action de l'Etat est organisée autour de 7 programmes, rattachés à une mission spécifique ministérielle et trois missions interministérielles :
Mission ministérielle "agriculture, pêche, forêt et affaires rurales" :
- programme : gestion durable de l'agriculture,
de la pêche et développement rural
- programme valorisation des produits, orientation et régulation des marchés
- programme : forêt
- programme : soutien des politiques publiques de l'agriculture
Mission interministérielle "enseignement scolaire" :
- programme : enseignement technique agricole
Mission interministérielle "recherche et enseignement supérieur" :
- programme : enseignement supérieur et recherche agricoles
Mission interministérielle "sécurité sanitaire" :
- programme : sécurité et qualité sanitaire de l'alimentation
Budget 2009
Le projet de loi de finances initiale 2009 dote le ministère de l’agriculture et la pêche de 5.042 milliards d’euros, soit une augmentation de 2.4% par rapport à 2008 (4.97 milliards d’euros). Dans un contexte de maîtrise des dépenses et de réduction des déficits publics auquel le ministère s’associe, ce projet de budget protège les dispositifs d’intervention, de gestion des crises et d’installation, et conforte le plan pour une pêche durable.
- Compte rendu de gestion budgétaire 2001 
