S'inspirant des exemples canadiens et scandinaves, l'État français s'est engagé dans une révision générale des politiques publiques (RGPP), lancée le 20 juin 2007 par Nicolas Sarkozy et le premier ministre François Fillon. Il s'agit d'améliorer l'action de l'État, l'efficacité et les conditions d'exercice des politiques publiques.
Plusieurs séries de mesures ont été adoptées lors des premiers Conseil de la modernisation des politiques publiques du 12 décembre 2007 et du 4 avril 2008 qui s'appliquent aux différents ministères dont celui en charge de l'agriculture et de la pêche. Dans ces domaines, elles visent à donner une meilleure lisibilité à l'organisation de l'État dans l'objectif général de "développer une politique alimentaire, agricole et rurale qui garantisse le développement économique, la sécurité sanitaire et préserve les équilibres écologiques", que souhaite animer Michel Barnier, ministre en exercice.
Ces réformes s'appliquent dès juillet 2008 et vont s'échelonner sur trois ans. Elles concernent les différents échelons d'activité du ministère et touchent l'ensemble des Français dans leur relation avec le service public qu'il s'agisse des professionnels de l'agriculture, de l'agroalimentaire, de la pêche, de la forêt, ou des simples citoyens, consommateurs, habitant ou se rendant ponctuellement pour leurs loisirs dans des territoires ruraux vivants et préservés.
Les chantiers déjà ouverts portent sur :
- la réorganisation de l’administration centrale,
- le regroupement des organismes de paiement des aides agricoles dans une agence unique,
- le rassemblement des offices d'intervention agricole dans un unique établissement,
- le renforcement du pilotage des politiques portées par le MAP au sein d’une direction régionale unique,
- la généralisation des DDEA par fusion des directions départementales de l'agriculture (DDAF) et de l'équipement (DDE) dans de nouvelles structures interministérielles,
- l’unicité du pilotage des contrôles en matière de pêche,
- la constitution d’une direction départementale traitant des questions de protection des personnes en matière de sécurité alimentaire et sanitaire, de protection des usagers et des consommateurs.
Le ministère de l'agriculture et de la pêche participe également au travail interministériel de regroupement des services d'inspection du travail et à leur rattachement à une direction régionale unique.